| Hvad er et kromosom?
Hvad er et plasmid? | Kromosom:
Cirkulært DNA. RNA (hvis virus)
1-5 milioner basepar.
1000-5000 gener.
Koder alle basale funktioner
Plasmid:
Cirkulært DNA. Dobbeltstrenget.
10.000-100.000 tusind basepar
10-100 gener
Koder ikke-essentielle funktioner, samt enzymer til egen replikation.
Ofte flere kopier.
Ikke essentielle. |
| Forklar hvad genomisk rekombination er for prokaryoter?
Forklar den homolog rekombination | Prokaryoter har aseksuel reproduktion - afkom er genetisk identiske, derfor laver de rekombination for at skabe genetisk variation:
Den sker promiskuøst = indenfor og på tværs af arter.
Den sker ugensidigt = involverer en donor og en modtager
Homolog rekombination:
Et stykke DNA (exogenote) fragtes fra donorcellen til modtagercellen.
Hvis der er homologe DNA sekvenser på modtagercellens kromosom (endogenote), kan de synapse. (Hybridiserer).
Udveksler alleler.
Herefter nedbrydes resten af exogenote.
Sker vha Endonuclease, der "åbner" DNA, herefter kommer RecA protein og krydser de to strenge med hinanden. Resolvase enzym separerer når baseparring er slut. |
| Forklar de tre genudvekslingsmekanismer overordnet | Transformation:
- Nøgent DNA optages fra omgivelserne.
Konjugation:
- Direkte kontakt mellem donor og modtager celle
- Kromosom transfer
Transduktion:
- Virus-medieret gen udveksling |
| Forklar tranformation | - Nøgent DNA fra omgivelserne bindes til DNA-binding proteiner.
- Den ene streng optages i cellen (nuclease)
- Der sker homolog rekombination (RecA protein)).
- Transformeret modtager celle. |
| Forklar konjugation
Samt eksemplet med F-plasmider | - Donor og modtager celler genkender hinanden via pilie (protein tråde) (binder til receptorer på modtager celle).
- Donor donerer konjugations plasmid igennem en pore (modtager har ingen plasmid).
- Dette sker via rolling circle replikation (transfer af den ene streng ind i modtager)
- Syntesen af den komplimentære streng begynder i modtager cellen.
Plasmiderne indeholder typisk gener involveret i konjugation og plasmid replikation. Dog er de ofte ikke udtrykt (koster energi at syntetiserer konjugations proteiner).
F-plasmider: Celler der har et kromosom-integreret F-plasmid kaldes Hfr.
Celler med et ikke-kromosom integreret F plasmid kaldes F+.
Her kalder man modtager celle F- (den der modtager F-plasmid og DNA, der kan integreres i cellens kromosom (homolog rekombination)) |
| Forklar transduktion
Forklar de 2 typer
Er det en fordel? | Virus-medieret gen udveksling - en del af den lysogene livscyklus (virus DNA integreres i værst genom = profag).
1. Generel:
- Vilkårlig værts kromosom stykker pakkes som følge af en pakningsfejl i virioner.
- Medfører der både laves virus DNA og værts DNA -> værts DNA vil ikke fungere optimalt, da der vil ske homolog rekombination, når den ankommer til modtagercelle. Kun nogle virionerne bliver ødelagt.
2. Specialiseret:
- Særlige værts gener pakkes sammen med virus genom i virions som følge af fejl i udskæring af profag fra værts genom. Her vil der komme værts DNA med i alle profag -> alle virusserne der bliver replikeret bliver defekte.
Hvis det går godt - virussen bliver replikeret.
Kan skabe genetisk variation der hjælper fagen.
Problem: Hvis der inkooporeres værtens arvemateriale som kan være resistent overfor virussen. |
