Como a polimerase sabe onde iniciar e finalizar a transcrição do gene? E como escolhe a fita molde?

Antes do início do gene (região que deve ser transcrita) existe uma sequência de nucleotídeo chamada de região promotora, pois promove o início da transcrição. Assim como a DNA-polimerase adiciona nucleotídeos na replicação do DNA, o sentido de síntese de nucleotídeos pela RNA-polimerase é de 5 -> 3. Dessa forma, a direção de transcrição e a fita utilizada como molde mudam conforme a posição do promotor se encontra em relação ao gene. Existe outra região chamada de terminador, que indica para a RNA-polimerase o fim do gene. Assim, a ordem das bases nucleotídicas de um gene é a sequência não utilizada como molde, ou seja, a mesma sequência do RNA sintetizado.